在安防工程中导入系统整合至关重要，而未来实施标准化后，则能更容易地进行系统整合工作。
目前很多厂商把标准看成是一个软件平台，或有工程商认为系统都需要自行发展一套标准软件来修正标准，其实都是错误的观念。工程商依照其原本软件或韧体工程师所使用的API工具，发展其本身系统架构功能，一样可达到整合的目的。此外，设备质量及系统维护不良等问题，也会增加系统整合的困难度。不论是整合前端视频来源，还是中端传输收编或后端管理，都会因采购发包方式或程序上的不良而引发工程争议及后续问题。如整合前端摄像机时，若要采用原有的摄像机，可能会因为厂商或业主的维护不良，导致画面模糊或功能失效，因此在整合后，仍无法呈现清晰画面。
再如整合中端传输收编时，若没有清楚定义既有及新系统之间的网络架构方式便进行整合，可能会影响网络传输质量或传输速度。或因为原来内网必须改为跨公共网域的VPN架构，所产生的电信费用，由于工程商未作详细说明，又没有编列预算或工程竞标后厂商毁约，导致无法长期支付电信费用，造成系统使用没多久，就因费用短绌而停摆的状况。
还有因原系统或线路保养不良，造成新系统整合完成后，常因旧设备不堪使用，因而产生许多工程争议。
追根究底，上述状况多由制度法规不够完善，无法提供公平合理的竞标环境所致；另外，部分工程商在工程设计及施工上的恶劣做法等，也是造成安防工程质量不良的来源。
